SEMA7A |
---|
|
Доступные структуры |
---|
PDB | Поиск ортологов: PDBe RCSB |
---|
Список идентификаторов PDB |
---|
3NVQ |
|
|
Идентификаторы |
---|
Псевдонимы | SEMA7A, CD108, CDw108, H-SEMA-K1, H-Sema-L, JMH, SEMAK1, SEMAL, semaphorin 7A (John Milton Hagen blood group), PFIC11 |
---|
Внешние ID | OMIM: 607961 MGI: 1306826 HomoloGene: 2678 GeneCards: SEMA7A |
---|
|
Расположение гена (Мышь) |
---|
| Хр. | 9-я хромосома мыши[2] |
---|
| Локус | 9|9 B | Начало | 57,847,395 bp[2] |
---|
Конец | 57,870,148 bp[2] |
---|
|
Паттерн экспрессии РНК |
---|
Bgee | Человек | Мышь (ортолог) |
---|
Наибольшая экспрессия в | - C1 segment
- primary visual cortex
- right hemisphere of cerebellum
- stromal cell of endometrium
- цитоархитектоническое поле Бродмана 9
|
| Наибольшая экспрессия в | - cumulus cell
- primary visual cortex
- lumbar subsegment of spinal cord
- anterior horn of spinal cord
- dentate gyrus of hippocampal formation granule cell
- lobe of cerebellum
|
| Дополнительные справочные данные |
|
---|
BioGPS | | Дополнительные справочные данные |
|
---|
|
Генная онтология |
---|
Молекулярная функция | - связывание с белками плазмы
- integrin binding
- neuropilin binding
- semaphorin receptor binding
- chemorepellent activity
| Компонент клетки | - мембрана
- клеточная мембрана
- anchored component of membrane
- внеклеточное пространство
- наружная сторона клеточной мембраны
- часть клеточной мембраны
- collagen-containing extracellular matrix
| Биологический процесс | - дифференцировка клеток
- positive regulation of protein phosphorylation
- развитие нервной системы
- multicellular organism development
- osteoblast differentiation
- иммунный ответ
- positive regulation of ERK1 and ERK2 cascade
- axon extension
- olfactory lobe development
- integrin-mediated signaling pathway
- positive regulation of axon extension
- воспалительная реакция
- neuron projection development
- regulation of inflammatory response
- negative chemotaxis
- positive regulation of macrophage cytokine production
- neural crest cell migration
- positive regulation of cell migration
- negative regulation of axon extension involved in axon guidance
- semaphorin-plexin signaling pathway
| Источники: Amigo, QuickGO |
|
Ортологи |
---|
Вид | Человек | Мышь |
---|
Entrez | | |
---|
Ensembl | |
---|
ENSG00000138623 ENSG00000288455 |
| |
---|
UniProt | | |
---|
RefSeq (мРНК) | |
---|
NM_003612 NM_001146029 NM_001146030 |
| |
---|
RefSeq (белок) | |
---|
NP_001139501 NP_001139502 NP_003603 |
| |
---|
Локус (UCSC) | Chr 15: 74.41 – 74.43 Mb | Chr 9: 57.85 – 57.87 Mb |
---|
Поиск по PubMed | Искать[3] | Искать[4] |
---|
|
Информация в Викиданных |
Смотреть (человек) | Смотреть (мышь) |
|
Семафорин-7A (англ. Semaphorin 7A, GPI membrane anchor; SEMA7A; CD108) — мембранный гликопротеин класса семафоринов, прикреплён к клеточной мембране за счёт гликозилфосфатидилинозитольной группы. Антиген группы крови John-Milton-Hagen (JMH). Продукт гена человека SEMA7A[5].
Структура
SEMA7A состоит из 666 аминокислот, молекулярная масса 74,8 кДа. Содержит один Ig-подобный домен типа C2. Гликозилфосфатидилинозитол заякоривает белок на мембране.
Взаимодействует с интегринами ITGA1 и ITGB1 и с рецептором семафоринов PLXNC1.
Функции
SEMA7A играет важную роль в интегрин-опосредованной передаче сигнала. Функционирует в регуляции клеточной миграции и в иммунном ответе. Стимулирует образование комплексов фокальной адгезии, активацию протеинкиназы PTK2/FAK1 и последующее фосфорилирование киназ MAPK1 и MAPK3. Стимулирует продукцию воспалительных цитокинов моноцитами и макрофагами. Играет важную роль в модулировании воспалительной реакции и T-клеточного иммунного ответа. Белок стимулирует рост аксонов в эмбриональной обонятельной луковице. Участвует в прикреплении меланоцитов, их росте и образовании дендритных отростков.
Кроме этого, белок служит рецептором малярийного паразита Plasmodium falciparum.
Группа крови JMH
Система группы крови John Milton Hagen (JMH) — высокочастотный антиген эритроцитарной группы крови человека.[6] Система состоит из 6 антигенов, расположенных на семафорине-7A[7], но, как правило, они не вызывают существенного гемолиза или гемолитических расстройств новорожденных.[8]
Тканевая локализация
Белок экспрессирован на активированных лимфоцитах и эритроцитах. Детектируется на кератиноцитах, эндотелиальных клетках кровеносных сосудов кожи. Экспрессирован на фибробрастах, меланоцитах, в плаценте, яичках, яичниках, селезёнке, мозге, спинном мозге, лёгких, сердце, надпочечниках, лимфатических узлах, вилочковой железе, кишечнике и почках.
Примечания
- ↑ 1 2 3 ENSG00000288455 GRCh38: Ensembl release 89: ENSG00000138623, ENSG00000288455 - Ensembl, May 2017
- ↑ 1 2 3 GRCm38: Ensembl release 89: ENSMUSG00000038264 - Ensembl, May 2017
- ↑ Ссылка на публикацию человека на PubMed: (неопр.) Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США.
- ↑ Ссылка на публикацию мыши на PubMed: (неопр.) Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США.
- ↑ Entrez Gene: SEMA7A semaphorin 7A, GPI membrane anchor (John Milton Hagen blood group) (неопр.).
- ↑ Bobolis, Kristie A.; Moulds, John J.; Telen, Marilyn J. Isolation of the JMH Antigen on a Novel Phosphatidylinositol-Linked Human Membrane Protein (англ.) : journal. Архивировано 21 октября 2018 года.
- ↑ Johnson, S.T. JMH blood group system: a review. (неопр.) // Immunohematology. — 2014. — Т. 30, № 1. — С. 18—23. — PMID 25238240.
- ↑ JMH (неопр.). bbguy.org. Дата обращения: 21 октября 2018. Архивировано 21 октября 2018 года.
Литература
- Xu X., Ng S., Wu Z.L., etal. Human semaphorin K1 is glycosylphosphatidylinositol-linked and defines a new subfamily of viral-related semaphorins. (англ.) // J. Biol. Chem. : journal. — 1998. — Vol. 273, no. 35. — P. 22428—22434. — doi:10.1074/jbc.273.35.22428. — PMID 9712866.
- Lange C., Liehr T., Goen M., etal. New eukaryotic semaphorins with close homology to semaphorins of DNA viruses. (англ.) // Genomics : journal. — Academic Press, 1998. — Vol. 51, no. 3. — P. 340—350. — doi:10.1006/geno.1998.5256. — PMID 9721204.
- Yamada A., Kubo K., Takeshita T., etal. Molecular cloning of a glycosylphosphatidylinositol-anchored molecule CDw108. (англ.) // J. Immunol.[англ.] : journal. — 1999. — Vol. 162, no. 7. — P. 4094—4100. — PMID 10201933.
- Angelisová P., Drbal K., Cerný J., etal. Characterization of the human leukocyte GPI-anchored glycoprotein CDw108 and its relation to other similar molecules. (англ.) // Immunobiology : journal. — 1999. — Vol. 200, no. 2. — P. 234—245. — doi:10.1016/s0171-2985(99)80073-4. — PMID 10416131.
- Tamagnone L., Artigiani S., Chen H., etal. Plexins are a large family of receptors for transmembrane, secreted, and GPI-anchored semaphorins in vertebrates. (англ.) // Cell : journal. — Cell Press, 1999. — Vol. 99, no. 1. — P. 71—80. — doi:10.1016/S0092-8674(00)80063-X. — PMID 10520995.
- Mine T., Harada K., Matsumoto T., etal. CDw108 expression during T-cell development. (англ.) // Tissue Antigens[англ.] : journal. — 2000. — Vol. 55, no. 5. — P. 429—436. — doi:10.1034/j.1399-0039.2000.550505.x. — PMID 10885563.
- Holmes S., Downs A.M., Fosberry A., etal. Sema7A is a potent monocyte stimulator. (неопр.) // Scand. J. Immunol.. — 2002. — Т. 56, № 3. — С. 270—275. — doi:10.1046/j.1365-3083.2002.01129.x. — PMID 12193228.
- Strausberg R.L., Feingold E.A., Grouse L.H., etal. Generation and initial analysis of more than 15,000 full-length human and mouse cDNA sequences. (англ.) // Proceedings of the National Academy of Sciences of the United States of America : journal. — 2003. — Vol. 99, no. 26. — P. 16899—16903. — doi:10.1073/pnas.242603899. — PMID 12477932. — PMC 139241.
- Ota T., Suzuki Y., Nishikawa T., etal. Complete sequencing and characterization of 21,243 full-length human cDNAs. (англ.) // Nat. Genet. : journal. — 2004. — Vol. 36, no. 1. — P. 40—5. — doi:10.1038/ng1285. — PMID 14702039.
- Gerhard D.S., Wagner L., Feingold E.A., etal. The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). (англ.) // Genome Res. : journal. — 2004. — Vol. 14, no. 10B. — P. 2121—2127. — doi:10.1101/gr.2596504. — PMID 15489334. — PMC 528928.
- Maurin J.C., Delorme G., Machuca-Gayet I., etal. Odontoblast expression of semaphorin 7A during innervation of human dentin. (англ.) // Matrix Biol.[англ.] : journal. — 2005. — Vol. 24, no. 3. — P. 232—238. — doi:10.1016/j.matbio.2005.03.005. — PMID 15907379.
- Hu Y., Malone J.P., Fagan A.M., etal. Comparative proteomic analysis of intra- and interindividual variation in human cerebrospinal fluid. (англ.) // Mol. Cell. Proteomics : journal. — 2006. — Vol. 4, no. 12. — P. 2000—2009. — doi:10.1074/mcp.M500207-MCP200. — PMID 16199891.
- Koh J.M., Oh B., Lee J.Y., etal. Association study of semaphorin 7a (sema7a) polymorphisms with bone mineral density and fracture risk in postmenopausal Korean women. (англ.) // J. Hum. Genet.[англ.] : journal. — 2006. — Vol. 51, no. 2. — P. 112—117. — doi:10.1007/s10038-005-0331-z. — PMID 16372136.
|
---|
1-50 | - CD1 (a-c, 1A, 1D, 1E)
- CD2
- CD3 (γ, δ, ε)
- CD4
- CD5
- CD6
- CD7
- CD8 (a)
- CD9
- CD10
- CD11 (a, b, c, d)
- CD13
- CD14
- CD15
- CD16 (A, B)
- CD18
- CD19
- CD20
- CD21
- CD22
- CD23
- CD24
- CD25
- CD26
- CD27
- CD28
- CD29
- CD30
- CD31
- CD32 (A, B)
- CD33
- CD34
- CD35
- CD36
- CD37
- CD38
- CD39
- CD40
- CD41
- CD42 (a, b, c, d)
- CD43
- CD44
- CD45
- CD46
- CD47
- CD48
- CD49 (a, b, c, d, e, f)
- CD50
|
---|
51-100 | - CD51
- CD52
- CD53
- CD54
- CD55
- CD56
- CD57
- CD58
- CD59
- CD61
- CD62 (E, L, P)
- CD63
- CD64 (A, B, C)
- CD66 (a, b, c, d, e, f)
- CD68
- CD69
- CD70
- CD71
- CD72
- CD73
- CD74
- CD78
- CD79 (a, b)
- CD80
- CD81
- CD82
- CD83
- CD84
- CD85 (a, d, e, h, j, k)
- CD86
- CD87
- CD88
- CD89
- CD90
- CD91
- CD92
- CD93
- CD94
- CD95
- CD96
- CD97
- CD98
- CD99
- CD100
|
---|
101-150 | |
---|
151-200 | - CD151
- CD152
- CD153
- CD154
- CD155
- CD156 (a, b, c)
- CD157
- CD158 (a, d, e, i, k)
- CD159 (a, c)
- CD160
- CD161
- CD162
- CD163
- CD164
- CD166
- CD167 (a, b)
- CD168
- CD169
- CD170
- CD171
- CD172 (a, b, g)
- CD174
- CD177
- CD178
- CD179 (a, b)
- CD181
- CD182
- CD183
- CD184
- CD185
- CD186
- CD191
- CD192
- CD193
- CD194
- CD195
- CD196
- CD197
- CDw198
- CDw199
- CD200
|
---|
201-250 | |
---|
251-300 | |
---|
301-350 | |
---|
351-400 | |
---|