BRF1 |
---|
|
Ідентифікатори |
---|
Символи | BRF1, BRF, BRF-1, GTF3B, HEL-S-76p, TAF3B2, TAF3C, TAFIII90, TF3B90, TFIIIB90, hBRF, CFDS, RNA polymerase III transcription initiation factor 90 kDa subunit, RNA polymerase III transcription initiation factor subunit, BRF1 RNA polymerase III transcription initiation factor subunit |
---|
Зовнішні ІД | OMIM: 604902 MGI: 1919558 HomoloGene: 1161 GeneCards: BRF1 |
---|
|
Пов'язані генетичні захворювання |
---|
cerebellar-facial-dental syndrome[1] |
Онтологія гена |
---|
Молекулярна функція | • TBP-class protein binding • зв'язування з іоном металу • RNA polymerase III general transcription initiation factor activity • RNA polymerase III type 3 promoter sequence-specific DNA binding • transcription factor binding • GO:0001948, GO:0016582 protein binding • translation initiation factor activity |
---|
Клітинна компонента | • transcription factor TFIIIB complex • клітинне ядро • нуклеоплазма |
---|
Біологічний процес | • rRNA transcription • tRNA transcription • GO:0009373 regulation of transcription, DNA-templated • transcription, DNA-templated • positive regulation of transcription by RNA polymerase III • transcription by RNA polymerase III • transcription initiation from RNA polymerase III promoter • transcription preinitiation complex assembly • DNA-templated transcription, initiation • RNA polymerase III preinitiation complex assembly • regulation of transcription by RNA polymerase III • translational initiation |
---|
Джерела:Amigo / QuickGO | |
Шаблон експресії |
---|
|
Більше даних |
Ортологи |
---|
Види | Людина | Миша |
---|
Entrez | | |
---|
Ensembl | | |
---|
UniProt | | |
---|
RefSeq (мРНК) | NM_001242786 NM_001242787 NM_001242788 NM_001242789 NM_001242790
| NM_001519 NM_145685 NM_145696 |
| |
---|
RefSeq (білок) | NP_001229715 NP_001229716 NP_001229717 NP_001229718 NP_001229719
| NP_001510 NP_663718 NP_663718.1 |
| |
---|
Локус (UCSC) | Хр. 14: 105.21 – 105.32 Mb | Хр. 12: 112.92 – 112.96 Mb |
---|
PubMed search | [2] | [3] |
---|
Вікідані |
Див./Ред. для людей | Див./Ред. для мишей |
|
BRF1 (англ. BRF1, RNA polymerase III transcription initiation factor subunit) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 14-ї хромосоми.[4] Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 677 амінокислот, а молекулярна маса — 73 840[5].
Послідовність амінокислот
10 | | 20 | | 30 | | 40 | | 50 |
MTGRVCRGCG | | GTDIELDAAR | | GDAVCTACGS | | VLEDNIIVSE | | VQFVESSGGG |
SSAVGQFVSL | | DGAGKTPTLG | | GGFHVNLGKE | | SRAQTLQNGR | | RHIHHLGNQL |
QLNQHCLDTA | | FNFFKMAVSR | | HLTRGRKMAH | | VIAACLYLVC | | RTEGTPHMLL |
DLSDLLQVNV | | YVLGKTFLLL | | ARELCINAPA | | IDPCLYIPRF | | AHLLEFGEKN |
HEVSMTALRL | | LQRMKRDWMH | | TGRRPSGLCG | | AALLVAARMH | | DFRRTVKEVI |
SVVKVCESTL | | RKRLTEFEDT | | PTSQLTIDEF | | MKIDLEEECD | | PPSYTAGQRK |
LRMKQLEQVL | | SKKLEEVEGE | | ISSYQDAIEI | | ELENSRPKAK | | GGLASLAKDG |
STEDTASSLC | | GEEDTEDEEL | | EAAASHLNKD | | LYRELLGGAP | | GSSEAAGSPE |
WGGRPPALGS | | LLDPLPTAAS | | LGISDSIREC | | ISSQSSDPKD | | ASGDGELDLS |
GIDDLEIDRY | | ILNESEARVK | | AELWMRENAE | | YLREQREKEA | | RIAKEKELGI |
YKEHKPKKSC | | KRREPIQAST | | AREAIEKMLE | | QKKISSKINY | | SVLRGLSSAG |
GGSPHREDAQ | | PEHSASARKL | | SRRRTPASRS | | GADPVTSVGK | | RLRPLVSTQP |
AKKVATGEAL | | LPSSPTLGAE | | PARPQAVLVE | | SGPVSYHADE | | EADEEEPDEE |
DGEPCVSALQ | | MMGSNDYGCD | | GDEDDGY |
Кодований геном білок за функціями належить до активаторів, фосфопротеїнів. Задіяний у таких біологічних процесах, як транскрипція, регуляція транскрипції, альтернативний сплайсинг. Білок має сайт для зв'язування з іонами металів, іоном цинку. Локалізований у ядрі.
Література
- Wang Z., Roeder R.G. (1995). Structure and function of a human transcription factor TFIIIB subunit that is evolutionarily conserved and contains both TFIIB- and high-mobility-group protein 2-related domains. Proc. Natl. Acad. Sci. U.S.A. 92: 7026—7030. PMID 7624363 DOI:10.1073/pnas.92.15.7026
- Mital R., Kobayashi R., Hernandez N. (1996). RNA polymerase III transcription from the human U6 and adenovirus type 2 VAI promoters has different requirements for human BRF, a subunit of human TFIIIB. Mol. Cell. Biol. 16: 7031—7042. PMID 8943358 DOI:10.1128/MCB.16.12.7031
- McCulloch V., Hardin P., Peng W., Ruppert J.M., Lobo-Ruppert S.M. (2000). Alternatively spliced hBRF variants function at different RNA polymerase III promoters. EMBO J. 19: 4134—4143. PMID 10921893 DOI:10.1093/emboj/19.15.4134
- The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res. 14: 2121—2127. 2004. PMID 15489334 DOI:10.1101/gr.2596504
- Fairley J.A., Scott P.H., White R.J. (2003). TFIIIB is phosphorylated, disrupted and selectively released from tRNA promoters during mitosis in vivo. EMBO J. 22: 5841—5850. PMID 14592981 DOI:10.1093/emboj/cdg544
Примітки
- ↑ Захворювання, генетично пов'язані з BRF1 переглянути/редагувати посилання на ВікіДаних.
- ↑ Human PubMed Reference:.
- ↑ Mouse PubMed Reference:.
- ↑ HUGO Gene Nomenclature Commitee, HGNC:11551 (англ.) . Процитовано 11 вересня 2017.
{{cite web}}
: Обслуговування CS1: Сторінки з параметром url-status, але без параметра archive-url (посилання) - ↑ UniProt, Q92994 (англ.) . Архів оригіналу за 25 вересня 2017. Процитовано 11 вересня 2017.
Див. також
| Це незавершена стаття про білки. Ви можете допомогти проєкту, виправивши або дописавши її. |
Портал «Біологія» Портал «Хімія» |
На цю статтю не посилаються інші статті Вікіпедії. Будь ласка розставте посилання відповідно до прийнятих рекомендацій. |