CSPG4 |
---|
|
Ідентифікатори |
---|
Символи | CSPG4, HMW-MAA, MCSP, MCSPG, MEL-CSPG, MSK16, NG2, chondroitin sulfate proteoglycan 4, CSPG4A |
---|
Зовнішні ІД | OMIM: 601172 MGI: 2153093 HomoloGene: 20445 GeneCards: CSPG4 |
---|
Онтологія гена |
---|
Молекулярна функція | • signal transducer activity • protein kinase binding |
---|
Клітинна компонента | • integral component of membrane • cell projection • мембрана • focal adhesion • клітинна мембрана • integral component of plasma membrane • extracellular region • cell surface • lysosomal lumen • apical plasma membrane • Golgi lumen • екзосома • lamellipodium membrane • GO:0005578 Позаклітинна матриця • collagen-containing extracellular matrix |
---|
Біологічний процес | • glycosaminoglycan metabolic process • диференціація клітин • GO:0007243 intracellular signal transduction • transmembrane receptor protein tyrosine kinase signaling pathway • chondroitin sulfate biosynthetic process • multicellular organism development • Ангіогенез • positive regulation of peptidyl-tyrosine phosphorylation • chondroitin sulfate catabolic process • dermatan sulfate biosynthetic process • проліферація • tissue remodeling • GO:0072468 сигнальна трансдукція • glial cell migration |
---|
Джерела:Amigo / QuickGO | |
Шаблон експресії |
---|
|
Більше даних |
Ортологи |
---|
Види | Людина | Миша |
---|
Entrez | | |
---|
Ensembl | | |
---|
UniProt | | |
---|
RefSeq (мРНК) | | |
---|
RefSeq (білок) | | |
---|
Локус (UCSC) | Хр. 15: 75.67 – 75.71 Mb | Хр. 9: 56.77 – 56.81 Mb |
---|
PubMed search | [1] | [2] |
---|
Вікідані |
Див./Ред. для людей | Див./Ред. для мишей |
|
CSPG4 (англ. Chondroitin sulfate proteoglycan 4) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 15-ї хромосоми.[3] Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 2 322 амінокислот, а молекулярна маса — 250 537[4].
Послідовність амінокислот
10 | | 20 | | 30 | | 40 | | 50 |
MQSGPRPPLP | | APGLALALTL | | TMLARLASAA | | SFFGENHLEV | | PVATALTDID |
LQLQFSTSQP | | EALLLLAAGP | | ADHLLLQLYS | | GRLQVRLVLG | | QEELRLQTPA |
ETLLSDSIPH | | TVVLTVVEGW | | ATLSVDGFLN | | ASSAVPGAPL | | EVPYGLFVGG |
TGTLGLPYLR | | GTSRPLRGCL | | HAATLNGRSL | | LRPLTPDVHE | | GCAEEFSASD |
DVALGFSGPH | | SLAAFPAWGT | | QDEGTLEFTL | | TTQSRQAPLA | | FQAGGRRGDF |
IYVDIFEGHL | | RAVVEKGQGT | | VLLHNSVPVA | | DGQPHEVSVH | | INAHRLEISV |
DQYPTHTSNR | | GVLSYLEPRG | | SLLLGGLDAE | | ASRHLQEHRL | | GLTPEATNAS |
LLGCMEDLSV | | NGQRRGLREA | | LLTRNMAAGC | | RLEEEEYEDD | | AYGHYEAFST |
LAPEAWPAME | | LPEPCVPEPG | | LPPVFANFTQ | | LLTISPLVVA | | EGGTAWLEWR |
HVQPTLDLME | | AELRKSQVLF | | SVTRGARHGE | | LELDIPGAQA | | RKMFTLLDVV |
NRKARFIHDG | | SEDTSDQLVL | | EVSVTARVPM | | PSCLRRGQTY | | LLPIQVNPVN |
DPPHIIFPHG | | SLMVILEHTQ | | KPLGPEVFQA | | YDPDSACEGL | | TFQVLGTSSG |
LPVERRDQPG | | EPATEFSCRE | | LEAGSLVYVH | | RGGPAQDLTF | | RVSDGLQASP |
PATLKVVAIR | | PAIQIHRSTG | | LRLAQGSAMP | | ILPANLSVET | | NAVGQDVSVL |
FRVTGALQFG | | ELQKQGAGGV | | EGAEWWATQA | | FHQRDVEQGR | | VRYLSTDPQH |
HAYDTVENLA | | LEVQVGQEIL | | SNLSFPVTIQ | | RATVWMLRLE | | PLHTQNTQQE |
TLTTAHLEAT | | LEEAGPSPPT | | FHYEVVQAPR | | KGNLQLQGTR | | LSDGQGFTQD |
DIQAGRVTYG | | ATARASEAVE | | DTFRFRVTAP | | PYFSPLYTFP | | IHIGGDPDAP |
VLTNVLLVVP | | EGGEGVLSAD | | HLFVKSLNSA | | SYLYEVMERP | | RHGRLAWRGT |
QDKTTMVTSF | | TNEDLLRGRL | | VYQHDDSETT | | EDDIPFVATR | | QGESSGDMAW |
EEVRGVFRVA | | IQPVNDHAPV | | QTISRIFHVA | | RGGRRLLTTD | | DVAFSDADSG |
FADAQLVLTR | | KDLLFGSIVA | | VDEPTRPIYR | | FTQEDLRKRR | | VLFVHSGADR |
GWIQLQVSDG | | QHQATALLEV | | QASEPYLRVA | | NGSSLVVPQG | | GQGTIDTAVL |
HLDTNLDIRS | | GDEVHYHVTA | | GPRWGQLVRA | | GQPATAFSQQ | | DLLDGAVLYS |
HNGSLSPRDT | | MAFSVEAGPV | | HTDATLQVTI | | ALEGPLAPLK | | LVRHKKIYVF |
QGEAAEIRRD | | QLEAAQEAVP | | PADIVFSVKS | | PPSAGYLVMV | | SRGALADEPP |
SLDPVQSFSQ | | EAVDTGRVLY | | LHSRPEAWSD | | AFSLDVASGL | | GAPLEGVLVE |
LEVLPAAIPL | | EAQNFSVPEG | | GSLTLAPPLL | | RVSGPYFPTL | | LGLSLQVLEP |
PQHGALQKED | | GPQARTLSAF | | SWRMVEEQLI | | RYVHDGSETL | | TDSFVLMANA |
SEMDRQSHPV | | AFTVTVLPVN | | DQPPILTTNT | | GLQMWEGATA | | PIPAEALRST |
DGDSGSEDLV | | YTIEQPSNGR | | VVLRGAPGTE | | VRSFTQAQLD | | GGLVLFSHRG |
TLDGGFRFRL | | SDGEHTSPGH | | FFRVTAQKQV | | LLSLKGSQTL | | TVCPGSVQPL |
SSQTLRASSS | | AGTDPQLLLY | | RVVRGPQLGR | | LFHAQQDSTG | | EALVNFTQAE |
VYAGNILYEH | | EMPPEPFWEA | | HDTLELQLSS | | PPARDVAATL | | AVAVSFEAAC |
PQRPSHLWKN | | KGLWVPEGQR | | ARITVAALDA | | SNLLASVPSP | | QRSEHDVLFQ |
VTQFPSRGQL | | LVSEEPLHAG | | QPHFLQSQLA | | AGQLVYAHGG | | GGTQQDGFHF |
RAHLQGPAGA | | SVAGPQTSEA | | FAITVRDVNE | | RPPQPQASVP | | LRLTRGSRAP |
ISRAQLSVVD | | PDSAPGEIEY | | EVQRAPHNGF | | LSLVGGGLGP | | VTRFTQADVD |
SGRLAFVANG | | SSVAGIFQLS | | MSDGASPPLP | | MSLAVDILPS | | AIEVQLRAPL |
EVPQALGRSS | | LSQQQLRVVS | | DREEPEAAYR | | LIQGPQYGHL | | LVGGRPTSAF |
SQFQIDQGEV | | VFAFTNFSSS | | HDHFRVLALA | | RGVNASAVVN | | VTVRALLHVW |
AGGPWPQGAT | | LRLDPTVLDA | | GELANRTGSV | | PRFRLLEGPR | | HGRVVRVPRA |
RTEPGGSQLV | | EQFTQQDLED | | GRLGLEVGRP | | EGRAPGPAGD | | SLTLELWAQG |
VPPAVASLDF | | ATEPYNAARP | | YSVALLSVPE | | AARTEAGKPE | | SSTPTGEPGP |
MASSPEPAVA | | KGGFLSFLEA | | NMFSVIIPMC | | LVLLLLALIL | | PLLFYLRKRN |
KTGKHDVQVL | | TAKPRNGLAG | | DTETFRKVEP | | GQAIPLTAVP | | GQGPPPGGQP |
DPELLQFCRT | | PNPALKNGQY | | WV |
Кодований геном білок за функціями належить до білків внутрішньоклітинного сигналінгу, білків розвитку, фосфопротеїнів. Задіяний у таких біологічних процесах, як ангіогенез, ремоделювання тканини, диференціація клітин. Локалізований у клітинній мембрані, мембрані, клітинних відростках.
Література
- Staub E., Hinzmann B., Rosenthal A. (2002). A novel repeat in the melanoma-associated chondroitin sulfate proteoglycan defines a new protein family. FEBS Lett. 527: 114—118. PMID 12220645 DOI:10.1016/S0014-5793(02)03195-2
- Fukushi J., Makagiansar I.T., Stallcup W.B. (2004). NG2 proteoglycan promotes endothelial cell motility and angiogenesis via engagement of galectin-3 and alpha3beta1 integrin. Mol. Biol. Cell. 15: 3580—3590. PMID 15181153 DOI:10.1091/mbc.E04-03-0236
Примітки
- ↑ Human PubMed Reference:.
- ↑ Mouse PubMed Reference:.
- ↑ HUGO Gene Nomenclature Commitee, HGNC:2466 (англ.) . Процитовано 11 вересня 2017.
{{cite web}}
: Обслуговування CS1: Сторінки з параметром url-status, але без параметра archive-url (посилання) - ↑ UniProt, Q6UVK1 (англ.) . Архів оригіналу за 26 серпня 2017. Процитовано 11 вересня 2017.
Див. також
| Це незавершена стаття про білки. Ви можете допомогти проєкту, виправивши або дописавши її. |
Портал «Біологія» Портал «Хімія» |
На цю статтю не посилаються інші статті Вікіпедії. Будь ласка розставте посилання відповідно до прийнятих рекомендацій. |