DOCK9

Наявні структури

Пошук ортологів: PDBe RCSB

Список кодів PDB
1WG7, 2WM9, 2WMN, 2WMO

Ідентифікатори

Символи

DOCK9, ZIZ1, ZIZIMIN1, Dock9, dedicator of cytokinesis 9

Зовнішні ІД

OMIM: 607325 MGI: 106321 HomoloGene: 41026 GeneCards: DOCK9

Онтологія гена
Молекулярна функція	• GO:0001948, GO:0016582 protein binding • guanyl-nucleotide exchange factor activity • cadherin binding
Клітинна компонента	• гіалоплазма • система ендомембран • мембрана
Біологічний процес	• зсідання крові • small GTPase mediated signal transduction • GO:0032320, GO:0032321, GO:0032855, GO:0043089, GO:0032854 positive regulation of GTPase activity • GO:0022610 життєдіяльність
Джерела:Amigo / QuickGO

Шаблон експресії

Більше даних

Ортологи

Види

Людина

Миша

Entrez


23348


105445

Ensembl


ENSG00000088387


ENSMUSG00000025558

UniProt


Q9BZ29


Q8BIK4

RefSeq (мРНК)

NM_001130048 NM_001130049 NM_001130050 NM_015296 NM_001318849
NM_001366676 NM_001366677 NM_001366678 NM_001366679 NM_001366680 NM_001366681 NM_001366682 NM_001366683 NM_001366684


NM_001081039 NM_001128307 NM_001128308 NM_134074 NM_001347596

RefSeq (білок)

NP_001123520 NP_001123521 NP_001123522 NP_001305778 NP_056111
NP_001353605 NP_001353606 NP_001353607 NP_001353608 NP_001353609 NP_001353610 NP_001353611 NP_001353612 NP_001353613


н/д

Локус (UCSC)

Хр. 13: 98.79 – 99.09 Mb

Хр. 14: 121.78 – 122.04 Mb

PubMed search

^[1]

^[2]

Вікідані

Див./Ред. для людей

Див./Ред. для мишей

DOCK9 (англ. Dedicator of cytokinesis 9) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 13-ї хромосоми.^[3] Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 2 069 амінокислот, а молекулярна маса — 236 446^[4].

Послідовність амінокислот

10	20	30	40	50
MSQPPLLPAS	AETRKFTRAL	SKPGTAAELR	QSVSEVVRGS	VLLAKPKLIE
PLDYENVIVQ	KKTQILNDCL	REMLLFPYDD	FQTAILRRQG	RYICSTVPAK
AEEEAQSLFV	TECIKTYNSD	WHLVNYKYED	YSGEFRQLPN	KVVKLDKLPV
HVYEVDEEVD	KDEDAASLGS	QKGGITKHGW	LYKGNMNSAI	SVTMRSFKRR
FFHLIQLGDG	SYNLNFYKDE	KISKEPKGSI	FLDSCMGVVQ	NNKVRRFAFE
LKMQDKSSYL	LAADSEVEME	EWITILNKIL	QLNFEAAMQE	KRNGDSHEDD
EQSKLEGSGS	GLDSYLPELA	KSAREAEIKL	KSESRVKLFY	LDPDAQKLDF
SSAEPEVKSF	EEKFGKRILV	KCNDLSFNLQ	CCVAENEEGP	TTNVEPFFVT
LSLFDIKYNR	KISADFHVDL	NHFSVRQMLA	TTSPALMNGS	GQSPSVLKGI
LHEAAMQYPK	QGIFSVTCPH	PDIFLVARIE	KVLQGSITHC	AEPYMKSSDS
SKVAQKVLKN	AKQACQRLGQ	YRMPFAWAAR	TLFKDASGNL	DKNARFSAIY
RQDSNKLSND	DMLKLLADFR	KPEKMAKLPV	ILGNLDITID	NVSSDFPNYV
NSSYIPTKQF	ETCSKTPITF	EVEEFVPCIP	KHTQPYTIYT	NHLYVYPKYL
KYDSQKSFAK	ARNIAICIEF	KDSDEEDSQP	LKCIYGRPGG	PVFTRSAFAA
VLHHHQNPEF	YDEIKIELPT	QLHEKHHLLL	TFFHVSCDNS	SKGSTKKRDV
VETQVGYSWL	PLLKDGRVVT	SEQHIPVSAN	LPSGYLGYQE	LGMGRHYGPE
IKWVDGGKPL	LKISTHLVST	VYTQDQHLHN	FFQYCQKTES	GAQALGNELV
KYLKSLHAME	GHVMIAFLPT	ILNQLFRVLT	RATQEEVAVN	VTRVIIHVVA
QCHEEGLESH	LRSYVKYAYK	AEPYVASEYK	TVHEELTKSM	TTILKPSADF
LTSNKLLKYS	WFFFDVLIKS	MAQHLIENSK	VKLLRNQRFP	ASYHHAVETV
VNMLMPHITQ	KFRDNPEASK	NANHSLAVFI	KRCFTFMDRG	FVFKQINNYI
SCFAPGDPKT	LFEYKFEFLR	VVCNHEHYIP	LNLPMPFGKG	RIQRYQDLQL
DYSLTDEFCR	NHFLVGLLLR	EVGTALQEFR	EVRLIAISVL	KNLLIKHSFD
DRYASRSHQA	RIATLYLPLF	GLLIENVQRI	NVRDVSPFPV	NAGMTVKDES
LALPAVNPLV	TPQKGSTLDN	SLHKDLLGAI	SGIASPYTTS	TPNINSVRNA
DSRGSLISTD	SGNSLPERNS	EKSNSLDKHQ	QSSTLGNSVV	RCDKLDQSEI
KSLLMCFLYI	LKSMSDDALF	TYWNKASTSE	LMDFFTISEV	CLHQFQYMGK
RYIARTGMMH	ARLQQLGSLD	NSLTFNHSYG	HSDADVLHQS	LLEANIATEV
CLTALDTLSL	FTLAFKNQLL	ADHGHNPLMK	KVFDVYLCFL	QKHQSETALK
NVFTALRSLI	YKFPSTFYEG	RADMCAALCY	EILKCCNSKL	SSIRTEASQL
LYFLMRNNFD	YTGKKSFVRT	HLQVIISVSQ	LIADVVGIGG	TRFQQSLSII
NNCANSDRLI	KHTSFSSDVK	DLTKRIRTVL	MATAQMKEHE	NDPEMLVDLQ
YSLAKSYAST	PELRKTWLDS	MARIHVKNGD	LSEAAMCYVH	VTALVAEYLT
RKEAVQWEPP	LLPHSHSACL	RRSRGGVFRQ	GCTAFRVITP	NIDEEASMME
DVGMQDVHFN	EDVLMELLEQ	CADGLWKAER	YELIADIYKL	IIPIYEKRRD
FERLAHLYDT	LHRAYSKVTE	VMHSGRRLLG	TYFRVAFFGQ	AAQYQFTDSE
TDVEGFFEDE	DGKEYIYKEP	KLTPLSEISQ	RLLKLYSDKF	GSENVKMIQD
SGKVNPKDLD	SKYAYIQVTH	VIPFFDEKEL	QERKTEFERS	HNIRRFMFEM
PFTQTGKRQG	GVEEQCKRRT	ILTAIHCFPY	VKKRIPVMYQ	HHTDLNPIEV
AIDEMSKKVA	ELRQLCSSAE	VDMIKLQLKL	QGSVSVQVNA	GPLAYARAFL
DDTNTKRYPD	NKVKLLKEVF	RQFVEACGQA	LAVNERLIKE	DQLEYQEEMK
ANYREMAKEL	SEIMHEQLG

A: Аланін
C: Цистеїн
D: Аспарагінова кислота
E: Глутамінова кислота
F: Фенілаланін
G: Гліцин
H: Гістидин
I: Ізолейцин
K: Лізин
L: Лейцин
M: Метіонін
N: Аспарагін
P: Пролін
Q: Глутамін
R: Аргінін
S: Серин
T: Треонін
V: Валін
W: Триптофан

Y: Тирозин

Кодований геном білок за функцією належить до фосфопротеїнів. Задіяний у такому біологічному процесі, як альтернативний сплайсинг. Локалізований у мембрані.

Література

Meller N., Irani-Tehrani M., Kiosses W.B., Del Pozo M.A., Schwartz M.A. (2002). Zizimin1, a novel Cdc42 activator, reveals a new GEF domain for Rho proteins. Nat. Cell Biol. 4: 639—647. PMID 12172552 DOI:10.1038/ncb835
The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res. 14: 2121—2127. 2004. PMID 15489334 DOI:10.1101/gr.2596504
Cote J.-F., Vuori K. (2002). Identification of an evolutionarily conserved superfamily of DOCK180-related proteins with guanine nucleotide exchange activity. J. Cell Sci. 115: 4901—4913. PMID 12432077 DOI:10.1242/jcs.00219
Beausoleil S.A., Villen J., Gerber S.A., Rush J., Gygi S.P. (2006). A probability-based approach for high-throughput protein phosphorylation analysis and site localization. Nat. Biotechnol. 24: 1285—1292. PMID 16964243 DOI:10.1038/nbt1240
Yang J., Zhang Z., Roe S.M., Marshall C.J., Barford D. (2009). Activation of Rho GTPases by DOCK exchange factors is mediated by a nucleotide sensor. Science. 325: 1398—1402. PMID 19745154 DOI:10.1126/science.1174468

Примітки

↑ Human PubMed Reference:.
↑ Mouse PubMed Reference:.
↑ HUGO Gene Nomenclature Commitee, HGNC:14132 (англ.) . Архів оригіналу за 13 березня 2016. Процитовано 11 вересня 2017.
↑ UniProt, Q9BZ29 (англ.) . Архів оригіналу за 30 вересня 2017. Процитовано 11 вересня 2017.