IFT88 |
---|
|
Ідентифікатори |
---|
Символи | IFT88, D13S1056E, DAF19, TG737, TTC10, hTg737, intraflagellar transport 88 |
---|
Зовнішні ІД | OMIM: 600595 MGI: 98715 HomoloGene: 4761 GeneCards: IFT88 |
---|
|
Пов'язані генетичні захворювання |
---|
біполярний афективний розлад, шизофренія, депресія клінічна[1] |
Онтологія гена |
---|
Молекулярна функція | • GO:0001948, GO:0016582 protein binding • kinesin binding |
---|
Клітинна компонента | • intraciliary transport particle B • цитоплазма • cell projection • ciliary tip • motile cilium • цитоскелет • Центріоль • війка • ciliary basal body • центросома • sperm flagellum • ciliary base • non-motile cilium • центр організації мікротрубочок |
---|
Біологічний процес | • regulation of cilium assembly • regulation of autophagosome assembly • cilium assembly • cell projection organization • intraciliary transport involved in cilium assembly • розвиток нирки • inner ear receptor cell stereocilium organization • non-motile cilium assembly • intraciliary transport |
---|
Джерела:Amigo / QuickGO | |
Шаблон експресії |
---|
|
Більше даних |
Ортологи |
---|
Види | Людина | Миша |
---|
Entrez | | |
---|
Ensembl | | |
---|
UniProt | | |
---|
RefSeq (мРНК) | NM_006531 NM_175605 NM_001318491 NM_001318493 NM_001353565
| NM_001353566 NM_001353567 NM_001353568 NM_001353569 NM_001353570 NM_001353571 NM_001353572 NM_001353573 NM_001353574 NM_001353575 NM_001353576 NM_001353577 NM_001353578 NM_001353579 |
| |
---|
RefSeq (білок) | NP_001305420 NP_001305422 NP_006522 NP_783195 NP_001340494
| NP_001340495 NP_001340496 NP_001340497 NP_001340498 NP_001340499 NP_001340500 NP_001340501 NP_001340502 NP_001340503 NP_001340504 NP_001340505 NP_001340506 NP_001340507 NP_001340508 |
| NP_033402 NP_001391322 NP_001391323 NP_001391324 NP_001391325
| NP_001391326 |
|
---|
Локус (UCSC) | Хр. 13: 20.57 – 20.69 Mb | Хр. 14: 57.66 – 57.76 Mb |
---|
PubMed search | [2] | [3] |
---|
Вікідані |
Див./Ред. для людей | Див./Ред. для мишей |
|
IFT88 (англ. Intraflagellar transport 88) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 13-ї хромосоми.[4] Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 833 амінокислот, а молекулярна маса — 94 270[5].
Послідовність амінокислот
10 | | 20 | | 30 | | 40 | | 50 |
MKFTNTKVQM | | MQNVHLAPET | | DEDDLYSGYN | | DYNPIYDIEE | | LENDAAFQQA |
VRTSHGRRPP | | ITAKISSTAV | | TRPIATGYGS | | KTSLASSIGR | | PMTGAIQDGV |
TRPMTAVRAA | | GFTKAALRGS | | AFDPLSQSRG | | PASPLEAKKK | | DSPEEKIKQL |
EKEVNELVEE | | SCIANSCGDL | | KLALEKAKDA | | GRKERVLVRQ | | REQVTTPENI |
NLDLTYSVLF | | NLASQYSVNE | | MYAEALNTYQ | | VIVKNKMFSN | | AGILKMNMGN |
IYLKQRNYSK | | AIKFYRMALD | | QVPSVNKQMR | | IKIMQNIGVT | | FIQAGQYSDA |
INSYEHIMSM | | APNLKAGYNL | | TICYFAIGDR | | EKMKKAFQKL | | ITVPLEIDED |
KYISPSDDPH | | TNLVTEAIKN | | DHLRQMERER | | KAMAEKYIMT | | SAKLIAPVIE |
TSFAAGYDWC | | VEVVKASQYV | | ELANDLEINK | | AVTYLRQKDY | | NQAVEILKVL |
EKKDSRVKSA | | AATNLSALYY | | MGKDFAQASS | | YADIAVNSDR | | YNPAALTNKG |
NTVFANGDYE | | KAAEFYKEAL | | RNDSSCTEAL | | YNIGLTYEKL | | NRLDEALDCF |
LKLHAILRNS | | AEVLYQIANI | | YELMENPSQA | | IEWLMQVVSV | | IPTDPQVLSK |
LGELYDREGD | | KSQAFQYYYE | | SYRYFPCNIE | | VIEWLGAYYI | | DTQFWEKAIQ |
YFERASLIQP | | TQVKWQLMVA | | SCFRRSGNYQ | | KALDTYKDTH | | RKFPENVECL |
RFLVRLCTDL | | GLKDAQEYAR | | KLKRLEKMKE | | IREQRIKSGR | | DGSGGSRGKR |
EGSASGDSGQ | | NYSASSKGER | | LSARLRALPG | | TNEPYESSSN | | KEIDASYVDP |
LGPQIERPKT | | AAKKRIDEDD | | FADEELGDDL | | LPE |
Задіяний у таких біологічних процесах, як біогенез та деградація війок, альтернативний сплайсинг. Локалізований у цитоплазмі, цитоскелеті, клітинних відростках, війках.
Література
- The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res. 14: 2121—2127. 2004. PMID 15489334 DOI:10.1101/gr.2596504
Примітки
- ↑ Захворювання, генетично пов'язані з IFT88 переглянути/редагувати посилання на ВікіДаних.
- ↑ Human PubMed Reference:.
- ↑ Mouse PubMed Reference:.
- ↑ HUGO Gene Nomenclature Commitee, HGNC:20606 (англ.) . Архів оригіналу за 16 вересня 2017. Процитовано 11 вересня 2017.
- ↑ UniProt, Q13099 (англ.) . Архів оригіналу за 1 вересня 2017. Процитовано 11 вересня 2017.
Див. також
| Це незавершена стаття про білки. Ви можете допомогти проєкту, виправивши або дописавши її. |
Портал «Біологія» Портал «Хімія» |
На цю статтю не посилаються інші статті Вікіпедії. Будь ласка розставте посилання відповідно до прийнятих рекомендацій. |