MFGE8 |
---|
|
Наявні структури |
---|
PDB | Пошук ортологів: PDBe RCSB | | |
Ідентифікатори |
---|
Символи | MFGE8, milk fat globule-EGF factor 8 protein, BA46, EDIL1, HMFG, HsT19888, MFG-E8, MFGM, OAcGD3S, SED1, SPAG10, hP47, milk fat globule EGF and factor V/VIII domain containing |
---|
Зовнішні ІД | OMIM: 602281 MGI: 102768 HomoloGene: 4334 GeneCards: MFGE8 |
---|
Онтологія гена |
---|
Молекулярна функція | • phosphatidylserine binding • phosphatidylethanolamine binding • integrin binding • extracellular matrix structural constituent |
---|
Клітинна компонента | • external side of plasma membrane • extrinsic component of plasma membrane • extracellular region • екзосома • GO:0005578 Позаклітинна матриця • extracellular vesicle • мембрана • міжклітинний простір • endoplasmic reticulum lumen • collagen-containing extracellular matrix |
---|
Біологічний процес | • phagocytosis, recognition • Ангіогенез • positive regulation of phagocytosis • positive regulation of apoptotic cell clearance • phagocytosis, engulfment • адгезія клітин • single fertilization • GO:0022415 viral process • посттрансляційна модифікація • apoptotic cell clearance |
---|
Джерела:Amigo / QuickGO | |
Шаблон експресії |
---|
|
Більше даних |
Ортологи |
---|
Види | Людина | Миша |
---|
Entrez | | |
---|
Ensembl | | |
---|
UniProt | | |
---|
RefSeq (мРНК) | | NM_001114614 NM_001310319 NM_001310320 NM_001310321 NM_005928 |
| |
---|
RefSeq (білок) | | NP_001108086 NP_001297248 NP_001297249 NP_001297250 NP_005919 |
| |
---|
Локус (UCSC) | Хр. 15: 88.9 – 88.91 Mb | Хр. 7: 78.78 – 78.8 Mb |
---|
PubMed search | [1] | [2] |
---|
Вікідані |
Див./Ред. для людей | Див./Ред. для мишей |
|
MFGE8 (англ. Milk fat globule-EGF factor 8 protein) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 15-ї хромосоми.[3] Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 387 амінокислот, а молекулярна маса — 43 123[4].
Послідовність амінокислот
10 | | 20 | | 30 | | 40 | | 50 |
MPRPRLLAAL | | CGALLCAPSL | | LVALDICSKN | | PCHNGGLCEE | | ISQEVRGDVF |
PSYTCTCLKG | | YAGNHCETKC | | VEPLGMENGN | | IANSQIAASS | | VRVTFLGLQH |
WVPELARLNR | | AGMVNAWTPS | | SNDDNPWIQV | | NLLRRMWVTG | | VVTQGASRLA |
SHEYLKAFKV | | AYSLNGHEFD | | FIHDVNKKHK | | EFVGNWNKNA | | VHVNLFETPV |
EAQYVRLYPT | | SCHTACTLRF | | ELLGCELNGC | | ANPLGLKNNS | | IPDKQITASS |
SYKTWGLHLF | | SWNPSYARLD | | KQGNFNAWVA | | GSYGNDQWLQ | | VDLGSSKEVT |
GIITQGARNF | | GSVQFVASYK | | VAYSNDSANW | | TEYQDPRTGS | | SKIFPGNWDN |
HSHKKNLFET | | PILARYVRIL | | PVAWHNRIAL | | RLELLGC |
Кодований геном білок за функцією належить до фосфопротеїнів. Задіяний у таких біологічних процесах, як клітинна адгезія, взаємодія хазяїн-вірус, ангіогенез, запліднення, альтернативний сплайсинг. Локалізований у мембрані. Також секретований назовні.
Література
- Couto J.R., Taylor M.R., Godwin S.G., Ceriani R.L., Peterson J.A. (1996). Cloning and sequence analysis of human breast epithelial antigen BA46 reveals an RGD cell adhesion sequence presented on an epidermal growth factor-like domain. DNA Cell Biol. 15: 281—286. PMID 8639264 DOI:10.1089/dna.1996.15.281
- The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res. 14: 2121—2127. 2004. PMID 15489334 DOI:10.1101/gr.2596504
- Giuffrida M.G., Cavaletto M., Giunta C., Conti A., Godovac-Zimmermann J. (1998). Isolation and characterization of full and truncated forms of human breast carcinoma protein BA46 from human milk fat globule membranes. J. Protein Chem. 17: 143—148. PMID 9535276 DOI:10.1023/A:1022531500370
- Taylor M.R., Couto J.R., Scallan C.D., Ceriani R.L., Peterson J.A. (1997). Lactadherin (formerly BA46), a membrane-associated glycoprotein expressed in human milk and breast carcinomas, promotes Arg-Gly-Asp (RGD)-dependent cell adhesion. DNA Cell Biol. 16: 861—869. PMID 9260929 DOI:10.1089/dna.1997.16.861
- Picariello G., Ferranti P., Mamone G., Roepstorff P., Addeo F. (2008). Identification of N-linked glycoproteins in human milk by hydrophilic interaction liquid chromatography and mass spectrometry. Proteomics. 8: 3833—3847. PMID 18780401 DOI:10.1002/pmic.200701057
- Raymond A., Ensslin M.A., Shur B.D. (2009). SED1/MFG-E8: a bi-motif protein that orchestrates diverse cellular interactions. J. Cell. Biochem. 106: 957—966. PMID 19204935 DOI:10.1002/jcb.22076
Примітки
- ↑ Human PubMed Reference:.
- ↑ Mouse PubMed Reference:.
- ↑ HUGO Gene Nomenclature Commitee, HGNC:7036 (англ.) . Архів оригіналу за 27 червня 2017. Процитовано 11 вересня 2017.
- ↑ UniProt, Q08431 (англ.) . Архів оригіналу за 24 липня 2017. Процитовано 11 вересня 2017.
Див. також
| Це незавершена стаття про білки. Ви можете допомогти проєкту, виправивши або дописавши її. |
Портал «Біологія» Портал «Хімія» |
На цю статтю не посилаються інші статті Вікіпедії. Будь ласка розставте посилання відповідно до прийнятих рекомендацій. |