NUP58

Наявні структури

Пошук ортологів: PDBe RCSB

Список кодів PDB
4JO7, 4JO9, 4JQ5, 5IJN, 5IJO

Ідентифікатори

Символи

NUP58, PRO2463, NUPL1, NUP45, nucleoporin 58kDa, nucleoporin 58

Зовнішні ІД

OMIM: 607615 MGI: 1919094 HomoloGene: 40924 GeneCards: NUP58

Онтологія гена
Молекулярна функція	• GO:0001948, GO:0016582 protein binding • nuclear localization sequence binding • GO:0005487 structural constituent of nuclear pore
Клітинна компонента	• ядерна мембрана • nuclear envelope • мембрана • клітинне ядро • ядерна пора • GO:0009327 protein-containing complex • host cell
Біологічний процес	• mRNA transport • protein heterotetramerization • protein heterooligomerization • nucleocytoplasmic transport • regulation of protein import into nucleus • protein transport • GO:0022415 viral process • protein homooligomerization • mRNA export from nucleus • protein import into nucleus • protein heterotrimerization • regulation of glycolytic process • tRNA export from nucleus • protein sumoylation • viral transcription • GO:1905616 regulation of gene silencing by miRNA • GO:0046795 intracellular transport of virus • regulation of cellular response to heat
Джерела:Amigo / QuickGO

Шаблон експресії

Більше даних

Ортологи

Види

Людина

Миша

Entrez


9818


71844

Ensembl


ENSG00000139496


ENSMUSG00000114797

UniProt


Q9BVL2


Q8R332

RefSeq (мРНК)


NM_001008564 NM_001008565 NM_014089 NM_014778


NM_170591 NM_001362439 NM_001362440

RefSeq (білок)


NP_001008564 NP_054808


NP_733479 NP_001349368 NP_001349369

Локус (UCSC)

Хр. 13: 25.3 – 25.37 Mb

Хр. 14: 60.44 – 60.49 Mb

PubMed search

^[1]

^[2]

Вікідані

Див./Ред. для людей

Див./Ред. для мишей

NUP58 (англ. Nucleoporin 58) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 13-ї хромосоми.^[3] Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 599 амінокислот, а молекулярна маса — 60 897^[4].

Послідовність амінокислот

10	20	30	40	50
MSTGFSFGSG	TLGSTTVAAG	GTSTGGVFSF	GTGASSNPSV	GLNFGNLGST
STPATTSAPS	SGFGTGLFGS	KPATGFTLGG	TNTGIATTIT	TGLTLGTPAT
TSAATTGFSL	GFNKPAASAT	PFALPITSTS	ASGLTLSSAL	TSTPAASTGF
TLNNLGGTTA	TTTTASTGLS	LGGALAGLGG	SLFQSTNTGT	SGLGQNALGL
TLGTTAATST	AGNEGLGGID	FSSSSDKKSD	KTGTRPEDSK	ALKDENLPPV
ICQDVENLQK	FVKEQKQVQE	EISRMSSKAM	LKVQEDIKAL	KQLLSLAANG
IQRNTLNIDK	LKIETAQELK	NAEIALRTQK	TPPGLQHEYA	APADYFRILV
QQFEVQLQQY	RQQIEELENH	LATQANNSHI	TPQDLSMAMQ	KIYQTFVALA
AQLQSIHENV	KVLKEQYLGY	RKMFLGDAVD	VFETRRAEAK	KWQNTPRVTT
GPTPFSTMPN	AAAVAMAATL	TQQQQPATGP	QPSLGVSFGT	PFGSGIGTGL
QSSGLGSSNL	GGFGTSSGFG	CSTTGASTFG	FGTTNKPSGS	LSAGFGSSST
SGFNFSNPGI	TASAGLTFGV	SNPASAGFGT	GGQLLQLKKP	PAGNKRGKR

A: Аланін
C: Цистеїн
D: Аспарагінова кислота
E: Глутамінова кислота
F: Фенілаланін
G: Гліцин
H: Гістидин
I: Ізолейцин
K: Лізин
L: Лейцин
M: Метіонін
N: Аспарагін
P: Пролін
Q: Глутамін
R: Аргінін
S: Серин
T: Треонін
V: Валін
W: Триптофан

Y: Тирозин

Кодований геном білок за функцією належить до фосфопротеїнів. Задіяний у таких біологічних процесах, як транспорт, транспорт білків, транспорт мРНК, транслокація, альтернативний сплайсинг. Локалізований у ядрі, мембрані, комплексі ядерної пори.

Література

The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res. 14: 2121—2127. 2004. PMID 15489334 DOI:10.1101/gr.2596504

Примітки

↑ Human PubMed Reference:.
↑ Mouse PubMed Reference:.
↑ HUGO Gene Nomenclature Commitee, HGNC:20261 (англ.) . Процитовано 11 вересня 2017.{{cite web}}: Обслуговування CS1: Сторінки з параметром url-status, але без параметра archive-url (посилання)
↑ UniProt, Q9BVL2 (англ.) . Архів оригіналу за 8 жовтня 2017. Процитовано 11 вересня 2017.