PARP2

Наявні структури

Пошук ортологів: PDBe RCSB

Список кодів PDB
3KCZ, 3KJD, 4PJV, 4TVJ, 4ZZX, 4ZZY, 5DSY, 5D5K

Ідентифікатори

Символи

PARP2, ADPRT2, ADPRTL2, ADPRTL3, ARTD2, PARP-2, pADPRT-2, poly(ADP-ribose) polymerase 2

Зовнішні ІД

OMIM: 607725 MGI: 1341112 HomoloGene: 4004 GeneCards: PARP2

Реагує на сполуку

олапаріб, talazoparib, niraparib^[1]

Онтологія гена
Молекулярна функція	• transferase activity • DNA binding • GO:0001948, GO:0016582 protein binding • DNA ligase (ATP) activity • glycosyltransferase activity • NAD+ ADP-ribosyltransferase activity • protein ADP-ribosylase activity • NAD DNA ADP-ribosyltransferase activity
Клітинна компонента	• цитоплазма • ядерце • клітинне ядро • нуклеоплазма
Біологічний процес	• DNA ligation involved in DNA repair • lagging strand elongation • protein ADP-ribosylation • GO:0100026 Репарація ДНК • extrinsic apoptotic signaling pathway • base-excision repair • peptidyl-serine ADP-ribosylation • positive regulation of cell growth involved in cardiac muscle cell development • negative regulation of neuron death • double-strand break repair • protein poly-ADP-ribosylation • DNA ADP-ribosylation • cellular response to DNA damage stimulus
Джерела:Amigo / QuickGO

Шаблон експресії

Більше даних

Ортологи

Види

Людина

Миша

Entrez


10038


11546

Ensembl


ENSG00000129484


ENSMUSG00000036023

UniProt


Q9UGN5


O88554

RefSeq (мРНК)


NM_001042618 NM_005484


NM_009632

RefSeq (білок)


NP_001036083 NP_005475


NP_033762

Локус (UCSC)

Хр. 14: 20.34 – 20.36 Mb

Хр. 14: 51.05 – 51.06 Mb

PubMed search

^[2]

^[3]

Вікідані

Див./Ред. для людей

Див./Ред. для мишей

PARP2 (англ. Poly(ADP-ribose) polymerase 2) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 14-ї хромосоми.^[4] Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 583 амінокислот, а молекулярна маса — 66 206^[5].

Послідовність амінокислот

10	20	30	40	50
MAARRRRSTG	GGRARALNES	KRVNNGNTAP	EDSSPAKKTR	RCQRQESKKM
PVAGGKANKD	RTEDKQDGMP	GRSWASKRVS	ESVKALLLKG	KAPVDPECTA
KVGKAHVYCE	GNDVYDVMLN	QTNLQFNNNK	YYLIQLLEDD	AQRNFSVWMR
WGRVGKMGQH	SLVACSGNLN	KAKEIFQKKF	LDKTKNNWED	REKFEKVPGK
YDMLQMDYAT	NTQDEEETKK	EESLKSPLKP	ESQLDLRVQE	LIKLICNVQA
MEEMMMEMKY	NTKKAPLGKL	TVAQIKAGYQ	SLKKIEDCIR	AGQHGRALME
ACNEFYTRIP	HDFGLRTPPL	IRTQKELSEK	IQLLEALGDI	EIAIKLVKTE
LQSPEHPLDQ	HYRNLHCALR	PLDHESYEFK	VISQYLQSTH	APTHSDYTMT
LLDLFEVEKD	GEKEAFREDL	HNRMLLWHGS	RMSNWVGILS	HGLRIAPPEA
PITGYMFGKG	IYFADMSSKS	ANYCFASRLK	NTGLLLLSEV	ALGQCNELLE
ANPKAEGLLQ	GKHSTKGLGK	MAPSSAHFVT	LNGSTVPLGP	ASDTGILNPD
GYTLNYNEYI	VYNPNQVRMR	YLLKVQFNFL	QLW

A: Аланін
C: Цистеїн
D: Аспарагінова кислота
E: Глутамінова кислота
F: Фенілаланін
G: Гліцин
H: Гістидин
I: Ізолейцин
K: Лізин
L: Лейцин
M: Метіонін
N: Аспарагін
P: Пролін
Q: Глутамін
R: Аргінін
S: Серин
T: Треонін
V: Валін
W: Триптофан

Y: Тирозин

Кодований геном білок за функціями належить до трансфераз, глікозилтрансфераз, фосфопротеїнів. Задіяний у таких біологічних процесах, як ацетилювання, альтернативний сплайсинг. Білок має сайт для зв'язування з НАД, ДНК. Локалізований у ядрі.

Література

Johansson M. (1999). A human poly(ADP-ribose) polymerase gene family (ADPRTL): cDNA cloning of two novel poly(ADP-ribose) polymerase homologues. Genomics. 57: 442—445. PMID 10329013 DOI:10.1006/geno.1999.5799
Berghammer H., Ebner M., Marksteiner R., Auer B. (1999). pADPRT-2: a novel mammalian polymerizing(ADP-ribosyl)transferase gene related to truncated pADPRT homologues in plants and Caenorhabditis elegans. FEBS Lett. 449: 259—263. PMID 10338144 DOI:10.1016/S0014-5793(99)00448-2
Hottiger M.O., Hassa P.O., Luscher B., Schuler H., Koch-Nolte F. (2010). Toward a unified nomenclature for mammalian ADP-ribosyltransferases. Trends Biochem. Sci. 35: 208—219. PMID 20106667 DOI:10.1016/j.tibs.2009.12.003
Gibbs-Seymour I., Fontana P., Rack J.G., Ahel I. (2016). HPF1/C4orf27 is a PARP-1-interacting protein that regulates PARP-1 ADP-ribosylation activity. Mol. Cell. 62: 432—442. PMID 27067600 DOI:10.1016/j.molcel.2016.03.008
Karlberg T., Hammarstrom M., Schutz P., Svensson L., Schuler H. (2010). Crystal structure of the catalytic domain of human PARP2 in complex with PARP inhibitor ABT-888. Biochemistry. 49: 1056—1058. PMID 20092359 DOI:10.1021/bi902079y

Примітки

↑ Сполуки, які фізично взаємодіють з Poly(ADP-ribose) polymerase 2 переглянути/редагувати посилання на ВікіДаних.
↑ Human PubMed Reference:.
↑ Mouse PubMed Reference:.
↑ HUGO Gene Nomenclature Commitee, HGNC:272 (англ.) . Архів оригіналу за 18 квітня 2017. Процитовано 11 вересня 2017.
↑ UniProt, Q9UGN5 (англ.) . Архів оригіналу за 12 квітня 2011. Процитовано 11 вересня 2017.