POLB

POLB
Наявні структури
PDBПошук ортологів: PDBe RCSB
Список кодів PDB

1BPX, 1BPY, 1BPZ, 1MQ2, 1MQ3, 1TV9, 1TVA, 1ZJM, 1ZJN, 1ZQA, 1ZQB, 1ZQC, 1ZQD, 1ZQE, 1ZQF, 1ZQG, 1ZQH, 1ZQI, 1ZQJ, 1ZQK, 1ZQL, 1ZQM, 1ZQN, 1ZQO, 1ZQP, 1ZQQ, 1ZQR, 1ZQS, 1ZQT, 2FMP, 2FMQ, 2FMS, 2I9G, 2ISO, 2ISP, 2P66, 2PXI, 3C2K, 3C2L, 3C2M, 3GDX, 3ISB, 3ISC, 3ISD, 3JPN, 3JPO, 3JPP, 3JPQ, 3JPR, 3JPS, 3JPT, 3LK9, 3MBY, 3OGU, 3RH4, 3RH5, 3RH6, 3RJE, 3RJF, 3RJG, 3RJH, 3RJI, 3RJJ, 3RJK, 3TFR, 3TFS, 4DO9, 4DOA, 4DOB, 4DOC, 4F5N, 4F5O, 4F5P, 4F5Q, 4F5R, 4GXI, 4GXJ, 4GXK, 4JWM, 4JWN, 4KLD, 4KLE, 4KLF, 4KLG, 4KLH, 4KLI, 4KLJ, 4KLL, 4KLM, 4KLO, 4KLQ, 4KLS, 4KLT, 4KLU, 4LVS, 4M2Y, 4M47, 4M9G, 4M9H, 4M9J, 4M9L, 4M9N, 4MF2, 4MF8, 4MFA, 4MFC, 4MFF, 4NLK, 4NLN, 4NLZ, 4NM1, 4NM2, 4NXZ, 4NY8, 4O5C, 4O5E, 4O5K, 4O9M, 4P2H, 4PGQ, 4PGX, 4PGY, 4PH5, 4PHA, 4PHD, 4PHE, 4PHP, 4PPX, 4R63, 4R64, 4R65, 4R66, 4RPX, 4RPY, 4RPZ, 4RQ0, 4RQ1, 4RQ2, 4RQ3, 4RQ4, 4RQ5, 4RQ6, 4RQ7, 4RQ8, 4RT2, 4RT3, 4TUP, 4TUQ, 4TUR, 4TUS, 4UAW, 4UAY, 4UAZ, 4UB1, 4UB2, 4UB3, 4UB4, 4UB5, 4UBB, 4UBC, 7ICE, 7ICF, 7ICG, 7ICH, 7ICI, 7ICJ, 7ICK, 7ICL, 7ICM, 7ICN, 7ICO, 7ICP, 7ICQ, 7ICR, 7ICS, 7ICT, 7ICU, 7ICV, 8ICA, 8ICB, 8ICC, 8ICE, 8ICF, 8ICG, 8ICH, 8ICI, 8ICJ, 8ICK, 8ICL, 8ICM, 8ICN, 8ICO, 8ICP, 8ICQ, 8ICR, 8ICS, 8ICT, 8ICU, 8ICV, 8ICW, 8ICX, 8ICY, 8ICZ, 9ICA, 9ICB, 9ICC, 9ICE, 9ICF, 9ICG, 9ICH, 9ICI, 9ICJ, 9ICK, 9ICL, 9ICM, 9ICN, 9ICO, 9ICP, 9ICQ, 9ICR, 9ICS, 9ICT, 9ICU, 9ICV, 9ICW, 9ICX, 9ICY, 5BOL, 5BOM, 5BPC, 5DB8, 5DBB, 5DBA, 5DB7, 5DBC, 5DB9, 5DB6, 4YMN, 4YN4, 4YMO, 4YMM, 4Z6C, 4Z6F, 4Z6D, 4Z6E

Ідентифікатори
Символи POLB, DNA polymerase beta
Зовнішні ІД OMIM: 174760 MGI: 97740 HomoloGene: 2013 GeneCards: POLB
Онтологія гена
Молекулярна функція

transferase activity
DNA binding
nucleotidyltransferase activity
microtubule binding
зв'язування з іоном металу
damaged DNA binding
GO:0001948, GO:0016582 protein binding
lyase activity
enzyme binding
DNA-directed DNA polymerase activity
DNA-(apurinic or apyrimidinic site) endonuclease activity
ДНК-полімераза
DNA polymerase activity

Клітинна компонента

цитоплазма
нуклеоплазма
spindle microtubule
мікротрубочка
клітинне ядро
GO:0009327 protein-containing complex

Біологічний процес

neuron apoptotic process
somatic hypermutation of immunoglobulin genes
pyrimidine dimer repair
nucleotide-excision repair, DNA gap filling
DNA-dependent DNA replication
DNA biosynthetic process
homeostasis of number of cells
response to hyperoxia
GO:0010260 старіння людини
spleen development
salivary gland morphogenesis
cellular response to DNA damage stimulus
immunoglobulin heavy chain V-D-J recombination
реплікація ДНК
somatic diversification of immunoglobulins
base-excision repair, gap-filling
intrinsic apoptotic signaling pathway in response to DNA damage
response to ethanol
inflammatory response
lymph node development
response to gamma radiation
GO:0100026 Репарація ДНК
GO:0097285 апоптоз
base-excision repair
base-excision repair, DNA ligation
protein deubiquitination
double-strand break repair via nonhomologous end joining

Джерела:Amigo / QuickGO
Шаблон експресії
Більше даних
Ортологи
Види Людина Миша
Entrez
5423
18970
Ensembl
ENSG00000070501
ENSMUSG00000031536
UniProt
P06746
Q8K409
RefSeq (мРНК)
NM_002690
NM_011130
RefSeq (білок)
NP_002681
NP_035260
Локус (UCSC) н/д Хр. 8: 23.12 – 23.14 Mb
PubMed search [1] [2]
Вікідані
Див./Ред. для людейДив./Ред. для мишей

POLB (англ. DNA polymerase beta) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 8-ї хромосоми.[3] Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 335 амінокислот, а молекулярна маса — 38 178[4].

Послідовність амінокислот
1020304050
MSKRKAPQETLNGGITDMLTELANFEKNVSQAIHKYNAYRKAASVIAKYP
HKIKSGAEAKKLPGVGTKIAEKIDEFLATGKLRKLEKIRQDDTSSSINFL
TRVSGIGPSAARKFVDEGIKTLEDLRKNEDKLNHHQRIGLKYFGDFEKRI
PREEMLQMQDIVLNEVKKVDSEYIATVCGSFRRGAESSGDMDVLLTHPSF
TSESTKQPKLLHQVVEQLQKVHFITDTLSKGETKFMGVCQLPSKNDEKEY
PHRRIDIRLIPKDQYYCGVLYFTGSDIFNKNMRAHALEKGFTINEYTIRP
LGVTGVAGEPLPVDSEKDIFDYIQWKYREPKDRSE

Кодований геном білок за функціями належить до трансфераз, ліаз. Задіяний у таких біологічних процесах, як пошкодження ДНК, репарація ДНК, синтез ДНК, реплікація ДНК, ацетилювання. Білок має сайт для зв'язування з іонами металів, ДНК, іоном магнію, іоном натрію. Локалізований у цитоплазмі, ядрі.

Література

  • The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res. 14: 2121—2127. 2004. PMID 15489334 DOI:10.1101/gr.2596504
  • Bennett R.A., Wilson D.M. III, Wong D., Demple B. (1997). Interaction of human apurinic endonuclease and DNA polymerase beta in the base excision repair pathway. Proc. Natl. Acad. Sci. U.S.A. 94: 7166—7169. PMID 9207062 DOI:10.1073/pnas.94.14.7166
  • Matsumoto Y., Kim K., Katz D.S., Feng J.-A. (1998). Catalytic center of DNA polymerase beta for excision of deoxyribose phosphate groups. Biochemistry. 37: 6456—6464. PMID 9572863 DOI:10.1021/bi9727545
  • Pelletier H., Sawaya M.R., Wolfle W., Wilson S.H., Kraut J. (1996). A structural basis for metal ion mutagenicity and nucleotide selectivity in human DNA polymerase beta. Biochemistry. 35: 12762—12777. PMID 8841119 DOI:10.1021/bi9529566
  • Pelletier H., Sawaya M.R. (1996). Characterization of the metal ion binding helix-hairpin-helix motifs in human DNA polymerase beta by X-ray structural analysis. Biochemistry. 35: 12778—12787. PMID 8841120 DOI:10.1021/bi960790i
  • Sawaya M.R., Prasad R., Wilson S.H., Kraut J., Pelletier H. (1997). Crystal structures of human DNA polymerase beta complexed with gapped and nicked DNA: evidence for an induced fit mechanism. Biochemistry. 36: 11205—11215. PMID 9287163 DOI:10.1021/bi9703812

Примітки

  1. Human PubMed Reference:.
  2. Mouse PubMed Reference:.
  3. HUGO Gene Nomenclature Commitee, HGNC:9174 (англ.) . Процитовано 7 вересня 2017.
  4. UniProt, P06746 (англ.) . Архів оригіналу за 24 серпня 2017. Процитовано 7 вересня 2017.

Див. також

  • Хромосома 8
Молекула міоглобіну Це незавершена стаття про білки.
Ви можете допомогти проєкту, виправивши або дописавши її.

П:  Портал «Біологія» П:  Портал «Хімія»