SGSM2 |
---|
|
Ідентифікатори |
---|
Символи | SGSM2, RUTBC1, small G protein signaling modulator 2 |
---|
Зовнішні ІД | OMIM: 611418 MGI: 2144695 HomoloGene: 14780 GeneCards: SGSM2 |
---|
Онтологія гена |
---|
Молекулярна функція | • GO:0005097, GO:0005099, GO:0005100 GTPase activator activity |
---|
Клітинна компонента | • система ендомембран • цитоплазма • Меланосома |
---|
Біологічний процес | • late endosome to Golgi transport • GO:0032320, GO:0032321, GO:0032855, GO:0043089, GO:0032854 positive regulation of GTPase activity • GO:0032861, GO:0032862, GO:0032856 activation of GTPase activity • regulation of vesicle fusion • intracellular protein transport |
---|
Джерела:Amigo / QuickGO | |
Ортологи |
---|
Види | Людина | Миша |
---|
Entrez | | |
---|
Ensembl | | |
---|
UniProt | | |
---|
RefSeq (мРНК) | | NM_001098509 NM_014853 NM_001346700 |
| |
---|
RefSeq (білок) | | NP_001091979 NP_001333629 NP_055668 |
| |
---|
Локус (UCSC) | Хр. 17: 2.34 – 2.38 Mb | Хр. 11: 74.74 – 74.79 Mb |
---|
PubMed search | [1] | [2] |
---|
Вікідані |
Див./Ред. для людей | Див./Ред. для мишей |
|
SGSM2 (англ. Small G protein signaling modulator 2) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 17-ї хромосоми.[3] Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 1 006 амінокислот, а молекулярна маса — 113 285[4].
Послідовність амінокислот
10 | | 20 | | 30 | | 40 | | 50 |
MGSAEDAVKE | | KLLWNVKKEV | | KQIMEEAVTR | | KFVHEDSSHI | | IALCGAVEAC |
LLHQLRRRAA | | GFLRSDKMAA | | LFTKVGKTCP | | VAGEICHKVQ | | ELQQQAEGRK |
PSGVSQEALR | | RQGSASGKAP | | ALSPQALKHV | | WVRTALIEKV | | LDKVVQYLAE |
NCSKYYEKEA | | LLADPVFGPI | | LASLLVGPCA | | LEYTKLKTAD | | HYWTDPSADE |
LVQRHRIRGP | | PTRQDSPAKR | | PALGIRKRHS | | SGSASEDRLA | | ACARECVESL |
HQNSRTRLLY | | GKNHVLVQPK | | EDMEAVPGYL | | SLHQSAESLT | | LKWTPNQLMN |
GTLGDSELEK | | SVYWDYALVV | | PFSQVVCIHC | | HQQKSGGTLV | | LVSQDGIQRP |
PLHFPQGGHL | | LSFLSCLENG | | LLPRGQLEPP | | LWTQQGKGKV | | FPKLRKRSSI |
RSVDMEEMGT | | GRATDYVFRI | | IYPGHRHEHN | | AGDMIEMQGF | | GPSLPAWHLE |
PLCSQGSSCL | | SCSSSSSPHA | | TPSHCSCIPD | | RLPLRLLCES | | MKRQIVSRAF |
YGWLAHCRHL | | STVRTHLSAL | | VHHSVIPPDR | | PPGASAGLTK | | DVWSKYQKDK |
KNYKELELLR | | QVYYGGIEHE | | IRKDVWPFLL | | GHYKFGMSKK | | EMEQVDAVVA |
ARYQQVLAEW | | KACEVVVRQR | | EREAHPATRT | | KFSSGSSIDS | | HVQRLIHRDS |
TISNDVFISV | | DDLEPPEPQD | | PEDSRPKPEQ | | EAGPGTPGTA | | VVEQQHSVEF |
DSPDSGLPSS | | RNYSVASGIQ | | SSLDEGQSVG | | FEEEDGGGEE | | GSSGPGPAAH |
TLREPQDPSQ | | EKPQAGELEA | | GEELAAVCAA | | AYTIELLDTV | | ALNLHRIDKD |
VQRCDRNYWY | | FTPPNLERLR | | DVMCSYVWEH | | LDVGYVQGMC | | DLLAPLLVTL |
DNDQLAYSCF | | SHLMKRMSQN | | FPNGGAMDTH | | FANMRSLIQI | | LDSELFELMH |
QNGDYTHFYF | | CYRWFLLDFK | | RELLYEDVFA | | VWEVIWAARH | | ISSEHFVLFI |
ALALVEAYRE | | IIRDNNMDFT | | DIIKFFNERA | | EHHDAQEILR | | IARDLVHKVQ |
MLIENK |
Кодований геном білок за функціями належить до активаторів гтфаз, фосфопротеїнів. Задіяний у такому біологічному процесі, як альтернативний сплайсинг. Локалізований у цитоплазмі.
Література
- Yang H., Sasaki T., Minoshima S., Shimizu N. (2007). Identification of three novel proteins (SGSM1, 2, 3) which modulate small G protein (RAP and RAB)-mediated signaling pathway. Genomics. 90: 249—260. PMID 17509819 DOI:10.1016/j.ygeno.2007.03.013
- The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res. 14: 2121—2127. 2004. PMID 15489334 DOI:10.1101/gr.2596504
- Nottingham R.M., Ganley I.G., Barr F.A., Lambright D.G., Pfeffer S.R. (2011). RUTBC1 protein, a Rab9A effector that activates GTP hydrolysis by Rab32 and Rab33B proteins. J. Biol. Chem. 286: 33213—33222. PMID 21808068 DOI:10.1074/jbc.M111.261115
- Marubashi S., Shimada H., Fukuda M., Ohbayashi N. (2016). RUTBC1 functions as a GTPase-activating protein for Rab32/38 and regulates melanogenic enzyme trafficking in melanocytes. J. Biol. Chem. 291: 1427—1440. PMID 26620560 DOI:10.1074/jbc.M115.684043
Примітки
- ↑ Human PubMed Reference:.
- ↑ Mouse PubMed Reference:.
- ↑ HUGO Gene Nomenclature Commitee, HGNC:29026 (англ.) . Процитовано 12 вересня 2017.
{{cite web}}
: Обслуговування CS1: Сторінки з параметром url-status, але без параметра archive-url (посилання) - ↑ UniProt, O43147 (англ.) . Архів оригіналу за 8 серпня 2017. Процитовано 12 вересня 2017.
Див. також
| Це незавершена стаття про білки. Ви можете допомогти проєкту, виправивши або дописавши її. |
Портал «Біологія» Портал «Хімія» |
На цю статтю не посилаються інші статті Вікіпедії. Будь ласка розставте посилання відповідно до прийнятих рекомендацій. |