SLC46A1 |
---|
|
Ідентифікатори |
---|
Символи | SLC46A1, G21, HCP1, PCFT, solute carrier family 46 member 1 |
---|
Зовнішні ІД | OMIM: 611672 MGI: 1098733 HomoloGene: 41693 GeneCards: SLC46A1 |
---|
|
Пов'язані генетичні захворювання |
---|
hereditary folate malabsorption[1] |
|
Реагує на сполуку |
---|
індометацин, метотрексат[2] |
Онтологія гена |
---|
Молекулярна функція | • transporter activity • folic acid binding • proton transmembrane transporter activity • methotrexate transmembrane transporter activity • folic acid transmembrane transporter activity • heme transmembrane transporter activity |
---|
Клітинна компонента | • цитоплазма • integral component of membrane • мембрана • cell surface • brush border membrane • apical plasma membrane • клітинна мембрана |
---|
Біологічний процес | • folate import across plasma membrane • proton transmembrane transport • heme transport • folic acid metabolic process • intestinal folate absorption • cellular iron ion homeostasis • folic acid transport • methotrexate transport • трансмембранний транспорт • GO:0015915 транспорт |
---|
Джерела:Amigo / QuickGO | |
Шаблон експресії |
---|
|
Більше даних |
Ортологи |
---|
Види | Людина | Миша |
---|
Entrez | | |
---|
Ensembl | | |
---|
UniProt | | |
---|
RefSeq (мРНК) | | |
---|
RefSeq (білок) | | |
---|
Локус (UCSC) | Хр. 17: 28.39 – 28.41 Mb | Хр. 11: 78.36 – 78.36 Mb |
---|
PubMed search | [3] | [4] |
---|
Вікідані |
Див./Ред. для людей | Див./Ред. для мишей |
|
SLC46A1 (англ. Solute carrier family 46 member 1) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 17-ї хромосоми.[5] Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 459 амінокислот, а молекулярна маса — 49 771[6].
Послідовність амінокислот
10 | | 20 | | 30 | | 40 | | 50 |
MEGSASPPEK | | PRARPAAAVL | | CRGPVEPLVF | | LANFALVLQG | | PLTTQYLWHR |
FSADLGYNGT | | RQRGGCSNRS | | ADPTMQEVET | | LTSHWTLYMN | | VGGFLVGLFS |
STLLGAWSDS | | VGRRPLLVLA | | SLGLLLQALV | | SVFVVQLQLH | | VGYFVLGRIL |
CALLGDFGGL | | LAASFASVAD | | VSSSRSRTFR | | MALLEASIGV | | AGMLASLLGG |
HWLRAQGYAN | | PFWLALALLI | | AMTLYAAFCF | | GETLKEPKST | | RLFTFRHHRS |
IVQLYVAPAP | | EKSRKHLALY | | SLAIFVVITV | | HFGAQDILTL | | YELSTPLCWD |
SKLIGYGSAA | | QHLPYLTSLL | | ALKLLQYCLA | | DAWVAEIGLA | | FNILGMVVFA |
FATITPLMFT | | GYGLLFLSLV | | ITPVIRAKLS | | KLVRETEQGA | | LFSAVACVNS |
LAMLTASGIF | | NSLYPATLNF | | MKGFPFLLGA | | GLLLIPAVLI | | GMLEKADPHL |
EFQQFPQSP |
Кодований геном білок за функцією належить до фосфопротеїнів. Задіяний у таких біологічних процесах, як транспорт, ацетилювання, альтернативний сплайсинг. Локалізований у клітинній мембрані, цитоплазмі, мембрані.
Література
- The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res. 14: 2121—2127. 2004. PMID 15489334 DOI:10.1101/gr.2596504
- Latunde-Dada G.O., Takeuchi K., Simpson R.J., McKie A.T. (2006). Haem carrier protein 1 (HCP1): expression and functional studies in cultured cells. FEBS Lett. 580: 6865—6870. PMID 17156779 DOI:10.1016/j.febslet.2006.11.048
- Sharma S., Dimasi D., Broeer S., Kumar R., Della N.G. (2007). Heme carrier protein 1 (HCP1) expression and functional analysis in the retina and retinal pigment epithelium. Exp. Cell Res. 313: 1251—1259. PMID 17335806 DOI:10.1016/j.yexcr.2007.01.019
- Duddempudi P.K., Nakashe P., Blanton M.P., Jansen M. (2013). The monomeric state of the proton-coupled folate transporter represents the functional unit in the plasma membrane. FEBS J. 280: 2900—2915. PMID 23601781 DOI:10.1111/febs.12293
- Wilson M.R., Hou Z., Matherly L.H. (2014). Substituted cysteine accessibility reveals a novel transmembrane 2-3 reentrant loop and functional role for transmembrane domain 2 in the human proton-coupled folate transporter. J. Biol. Chem. 289: 25287—25295. PMID 25053408 DOI:10.1074/jbc.M114.578252
Примітки
- ↑ Захворювання, генетично пов'язані з SLC46A1 переглянути/редагувати посилання на ВікіДаних.
- ↑ Сполуки, які фізично взаємодіють з SLC46A1 переглянути/редагувати посилання на ВікіДаних.
- ↑ Human PubMed Reference:.
- ↑ Mouse PubMed Reference:.
- ↑ HUGO Gene Nomenclature Commitee, HGNC:30521 (англ.) . Архів оригіналу за 25 березня 2016. Процитовано 12 вересня 2017.
- ↑ UniProt, Q96NT5 (англ.) . Архів оригіналу за 1 серпня 2017. Процитовано 12 вересня 2017.
Див. також
Портал «Біологія» Портал «Хімія» |
На цю статтю не посилаються інші статті Вікіпедії. Будь ласка розставте посилання відповідно до прийнятих рекомендацій. |
| Це незавершена стаття про білки. Ви можете допомогти проєкту, виправивши або дописавши її. |