ZC3H13 |
---|
|
Ідентифікатори |
---|
Символи | ZC3H13, KIAA0853, zinc finger CCCH-type containing 13, Xio |
---|
Зовнішні ІД | OMIM: 616453 MGI: 1914552 GeneCards: ZC3H13 |
---|
Онтологія гена |
---|
Молекулярна функція | • GO:0001948, GO:0016582 protein binding • зв'язування з іоном металу • RNA binding |
---|
Клітинна компонента | • nuclear speck • клітинне ядро • нуклеоплазма • RNA N6-methyladenosine methyltransferase complex |
---|
Біологічний процес | • mRNA processing • multicellular organism development • Сплайсинг РНК • mRNA methylation • regulation of stem cell population maintenance |
---|
Джерела:Amigo / QuickGO | |
Шаблон експресії |
---|
|
Більше даних |
Ортологи |
---|
Види | Людина | Миша |
---|
Entrez | | |
---|
Ensembl | | |
---|
UniProt | | |
---|
RefSeq (мРНК) | NM_015070 NM_001076788 NM_001330564 NM_001330565 NM_001330566
| NM_001330567 NM_001382206 NM_001382207 NM_001382208 NM_001382209 NM_001382210 NM_001382211 NM_001382212 NM_001382213 NM_001382214 |
| | NM_026083 NM_027377 NM_001359875 |
|
---|
RefSeq (білок) | NP_001070256 NP_001317493 NP_001317494 NP_001317495 NP_001317496
| NP_055885 NP_001369135 NP_001369136 NP_001369137 NP_001369138 NP_001369139 NP_001369140 NP_001369141 NP_001369142 NP_001369143 |
| |
---|
Локус (UCSC) | Хр. 13: 45.95 – 46.05 Mb | Хр. 14: 75.52 – 75.58 Mb |
---|
PubMed search | [1] | [2] |
---|
Вікідані |
Див./Ред. для людей | Див./Ред. для мишей |
|
ZC3H13 (англ. Zinc finger CCCH-type containing 13) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 13-ї хромосоми.[3] Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 1 668 амінокислот, а молекулярна маса — 196 635[4].
Послідовність амінокислот
10 | | 20 | | 30 | | 40 | | 50 |
MSKIRRKVTV | | ENTKTISDST | | SRRPSVFERL | | GPSTGSTAET | | QCRNWLKTGN |
CLYGNTCRFV | | HGPSPRGKGY | | SSNYRRSPER | | PTGDLRERMK | | NKRQDVDTEP |
QKRNTEESSS | | PVRKESSRGR | | HREKEDIKIT | | KERTPESEEE | | NVEWETNRDD |
SDNGDINYDY | | VHELSLEMKR | | QKIQRELMKL | | EQENMEKREE | | IIIKKEVSPE |
VVRSKLSPSP | | SLRKSSKSPK | | RKSSPKSSSA | | SKKDRKTSAV | | SSPLLDQQRN |
SKTNQSKKKG | | PRTPSPPPPI | | PEDIALGKKY | | KEKYKVKDRI | | EEKTRDGKDR |
GRDFERQREK | | RDKPRSTSPA | | GQHHSPISSR | | HHSSSSQSGS | | SIQRHSPSPR |
RKRTPSPSYQ | | RTLTPPLRRS | | ASPYPSHSLS | | SPQRKQSPPR | | HRSPMREKGR |
HDHERTSQSH | | DRRHERREDT | | RGKRDREKDS | | REEREYEQDQ | | SSSRDHRDDR |
EPRDGRDRRD | | ARDTRDRREL | | RDSRDMRDSR | | EMRDYSRDTK | | ESRDPRDSRS |
TRDAHDYRDR | | EGRDTHRKED | | TYPEESRSYG | | RNHLREESSR | | TEIRNESRNE |
SRSEIRNDRM | | GRSRGRVPEL | | PEKGSRGSRG | | SQIDSHSSNS | | NYHDSWETRS |
SYPERDRYPE | | RDNRDQARDS | | SFERRHGERD | | RRDNRERDQR | | PSSPIRHQGR |
NDELERDERR | | EERRVDRVDD | | RRDERARERD | | RERERDRERE | | RERERERDRE |
REKERELERE | | RARERERERE | | KERDRERDRD | | RDHDRERERE | | RERDREKERE |
REREERERER | | ERERERERER | | ERERERARER | | DKERERQRDW | | EDKDKGRDDR |
REKREEIRED | | RNPRDGHDER | | KSKKRYRNEG | | SPSPRQSPKR | | RREHSPDSDA |
YNSGDDKNEK | | HRLLSQVVRP | | QESRSLSPSH | | LTEDRQGRWK | | EEDRKPERKE |
SSRRYEEQEL | | KEKVSSVDKQ | | REQTEILESS | | RMRAQDIIGH | | HQSEDRETSD |
RAHDENKKKA | | KIQKKPIKKK | | KEDDVGIERG | | NIETTSEDGQ | | VFSPKKGQKK |
KSIEKKRKKS | | KGDSDISDEE | | AAQQSKKKRG | | PRTPPITTKE | | ELVEMCNGKN |
GILEDSQKKE | | DTAFSDWSDE | | DVPDRTEVTE | | AEHTATATTP | | GSTPSPLSSL |
LPPPPPVATA | | TATTVPATLA | | ATTAAAATSF | | STSAITISTS | | ATPTNTTNNT |
FANEDSHRKC | | HRTRVEKVET | | PHVTIEDAQH | | RKPMDQKRSS | | SLGSNRSNRS |
HTSGRLRSPS | | NDSAHRSGDD | | QSGRKRVLHS | | GSRDREKTKS | | LEITGERKSR |
IDQLKRGEPS | | RSTSSDRQDS | | RSHSSRRSSP | | ESDRQVHSRS | | GSFDSRDRLQ |
ERDRYEHDRE | | RERERRDTRQ | | REWDRDADKD | | WPRNRDRDRL | | RERERERERD |
KRRDLDRERE | | RLISDSVERD | | RDRDRDRTFE | | SSQIESVKRC | | EAKLEGEHER |
DLESTSRDSL | | ALDKERMDKD | | LGSVQGFEET | | NKSERTESLE | | GDDESKLDDA |
HSLGSGAGEG | | YEPISDDELD | | EILAGDAEKR | | EDQQDEEKMP | | DPLDVIDVDW |
SGLMPKHPKE | | PREPGAALLK | | FTPGAVMLRV | | GISKKLAGSE | | LFAKVKETCQ |
RLLEKPKDAD | | NLFEHELGAL | | NMAALLRKEE | | RASLLSNLGP | | CCKALCFRRD |
SAIRKQLVKN | | EKGTIKQAYT | | SAPMVDNELL | | RLSLRLFKRK | | TTCHAPGHEK |
TEDNKLSQSS | | IQQELCVS |
Кодований геном білок за функцією належить до фосфопротеїнів. Задіяний у такому біологічному процесі, як альтернативний сплайсинг. Білок має сайт для зв'язування з іонами металів, іоном цинку. Локалізований у ядрі.
Література
- Beausoleil S.A., Villen J., Gerber S.A., Rush J., Gygi S.P. (2006). A probability-based approach for high-throughput protein phosphorylation analysis and site localization. Nat. Biotechnol. 24: 1285—1292. PMID 16964243 DOI:10.1038/nbt1240
- Hendriks I.A., Treffers L.W., Verlaan-de Vries M., Olsen J.V., Vertegaal A.C. (2015). SUMO-2 orchestrates chromatin modifiers in response to DNA damage. Cell Rep. 10: 1778—1791. PMID 25772364 DOI:10.1016/j.celrep.2015.02.033
Примітки
- ↑ Human PubMed Reference:.
- ↑ Mouse PubMed Reference:.
- ↑ HUGO Gene Nomenclature Commitee, HGNC:20368 (англ.) . Процитовано 11 вересня 2017.
{{cite web}}
: Обслуговування CS1: Сторінки з параметром url-status, але без параметра archive-url (посилання) - ↑ UniProt, Q5T200 (англ.) . Архів оригіналу за 1 лютого 2018. Процитовано 11 вересня 2017.
Див. також
| Це незавершена стаття про білки. Ви можете допомогти проєкту, виправивши або дописавши її. |
Портал «Біологія» Портал «Хімія» |
На цю статтю не посилаються інші статті Вікіпедії. Будь ласка розставте посилання відповідно до прийнятих рекомендацій. |